Se ha descrito como "muy similar" a Heteractis aurora de varias maneras, comúnmente exhibiendo "tentáculos con barras transversales hinchadas"  que llevan grandes grupos de nematocistos urticantes.  Sin embargo, P. crucifer también se puede encontrar con tentáculos lisos, a veces en las inmediaciones de un espécimen con barras transversales hinchadas.

El disco, plano y bordeado con unos 200 tentáculos cortos, puede crecer hasta 15 centímetros (5,9 pulgadas) de ancho. La columna, completamente extendida, puede alcanzar de 15 a 20 centímetros (5,9 a 7,9 pulgadas) de largo con un diámetro de 51 a 76 milímetros (2,0 a 3,0 pulgadas) en individuos grandes; sin embargo, la mayoría de los individuos tienen solo la mitad de esta longitud y diámetro. P. crucifer exhibe un alto grado de variabilidad de color, que va desde arena o beige hasta verde opaco o incluso rojo. La base de la columna es generalmente de color crema con vetas de color rojo, grisáceo hacia la parte superior. Filas de rayas claras y oscuras y protuberancias irradian hacia afuera desde la boca, variando en color desde verde brillante en el centro hasta marrón, lavanda, amarillo o blanco hacia afuera. Tiene ventosas de color rojo brillante en su columna, a las que se pueden adherir escombros para camuflarse.

P. crucifer habita en los fondos arenosos del mar Caribe y se puede encontrar en las Indias Occidentales. La parte principal (columna) de la anémona generalmente está enterrada en la arena, anclada a una roca debajo de la superficie, de modo que cuando se la perturba, la anémona puede retroceder al sustrato. Documentada como una especie a menudo asociada con arrecifes de coral y salientes rocosos, P. crucifer es capaz de retirarse a grietas y agujeros si se agita.

Se ha observado que el ciclo reproductivo de esta especie es prolongado (más largo que el anual o el bianual), lo que sugiere diferencias entre los ciclos reproductivos de las anémonas marinas tropicales y los de las anémonas de aguas más frías. P. crucifer puede reproducirse sexualmente, y los huevos se convierten en larvas dentro del padre. P. crucifer es una especie dioica, que tiene individuos claramente masculinos y femeninos y huevos grandes.